跨专业论文撰写时，万方查重是必不可少的工具之一。在使用万方查重时，首先要了解其查重原理，避免误解查重结果。其次，要注意文献引用的规范性和准确性，避免误判为抄袭。此外，还要注意文献翻译的准确性，避免语言差异导致的误判。最后，要及时保存查重报告，以备日后查证。

另外，在跨专业论文中，还需要注意避免过度依赖万方查重工具，应该结合自身的理解和分析，保持独立思考。同时，要注意保护个人隐私信息，在提交查重时进行必要的信息屏蔽。此外，还应该定期更新万方查重工具，以确保查重结果的准确性和及时性。